如果升主动脉上有硬化斑块，手术中可能因为手术操作而脱落，脱落的斑块栓塞大脑导致脑卒中。引起脑卒中的另一原因可能是形成脑血栓。这些病人术后立即出现症状，表现为持续昏迷或肢体瘫痪。如果手术病人完全从麻醉中清醒以后再出现脑卒中，一般与手术无直接关系。多为原先合并脑血管疾病的急性发作。因为冠心病患者的动脉粥样硬化性病变，并不仅仅发生在心脏上的冠状动脉上，全身各个脏器的动脉也有可能发生病变，脑血管也不例外。有相当一部分冠心病病人同时合并脑血管的病变。这些人在手术打击后就容易发生脑梗塞、脑出血等脑血管意外，出现失语、肢体瘫痪、昏迷等症状。需要进一步救治。有少数危重病人会因救治无效导致死亡。不过总的来说，冠状动脉旁路移植术后发生脑卒中的机率是较低的。